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干干干干貨!為什么你提取的RNA總是被降解?

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“大風(fēng)起兮云飛揚(yáng),蒼天佑我效率強(qiáng)”,以前上學(xué)的時(shí)候,每每提取RNA之前,都要默念幾遍(我太難了。RNA提取怕是所有分子實(shí)驗(yàn)室的必備的技能了,但是提取的效果可能經(jīng)常會(huì)有些不盡人意,忽好忽壞。

今天我們就來(lái)說(shuō)說(shuō)提取RNA被降解的那些事兒。

RNA樣品特別容易受到環(huán)境因素影響,組織取出后沒(méi)有馬上處理或冷凍;待提取rna的樣品沒(méi)有保存于-60至-70℃,而保存在了-5至-20℃;細(xì)胞在用胰酶處理時(shí)過(guò)度;溶液或離心管未經(jīng)Rnase去除處理,這些都會(huì)導(dǎo)致辛苦提出的RNA被降解,特別是大名鼎鼎的RNA酶 (RNase),通常我們?nèi)蔽溲b、小心翼翼,但還是會(huì)受到RNA酶的降解,核糖核酸酶(RNase)或稱(chēng)RNA酶,是一種可將RNA水解成小分子組成的核酸酶。RNase作為一個(gè)小分子的蛋白,卻異常的穩(wěn)定。常規(guī)的高溫高壓蒸汽滅菌和蛋白抑制劑都不能使它完全失活,聽(tīng)著就很頑固。

除了具有極佳的穩(wěn)定性,RNA酶在實(shí)驗(yàn)室無(wú)處不在。它是生物的一種防御機(jī)制,對(duì)于一個(gè)細(xì)胞來(lái)說(shuō)外源性的RNA往往是致命的,相比于外源性的DNA,外源性的RNA往往更加危險(xiǎn),一不注意外源性的RNA就愉快的轉(zhuǎn)錄翻譯了,所以幾乎所有的生物都進(jìn)化出了RNA酶用來(lái)防御外源性RNA的入侵。因此實(shí)驗(yàn)室培養(yǎng)的細(xì)菌細(xì)胞以及提取RNA的你都散發(fā)著RNA酶的香氣,人類(lèi)的體液(唾液、眼淚等)甚至手指中都含有大量的RNA酶,所以操作時(shí)要戴好口罩,盡量避免與人交談,還要做到勤換手套。

其次,操作時(shí)使用的儀器、耗材,包括槍頭、離心管、移液器也要確保是無(wú)RNA酶的,剛剛說(shuō)了單純的滅菌是不能滅活RNase的,所以槍頭和離心管要用DEPC處理,也就是說(shuō)使用表明是DEPC處理的產(chǎn)品。移液器最好是有一套專(zhuān)用的,使用之前用75%的酒精擦拭干凈,尤其是桿子。使用的水、緩沖劑要確保無(wú)RNA酶,使用的實(shí)驗(yàn)臺(tái)面最起碼要用75%的酒精擦拭,反正就是你實(shí)驗(yàn)過(guò)程中所用到的各種儀器設(shè)備,你都要對(duì)它了如指掌。

樣本選擇時(shí)一定要選取新鮮的樣本組織或者取樣后迅速低溫處理(液氮速凍);樣本出現(xiàn)多次反復(fù)凍融后,RNA得率會(huì)嚴(yán)重下降,也會(huì)導(dǎo)致RNA降解;對(duì)于血液樣本,如果樣本中含有血塊,說(shuō)明樣本收集時(shí)未加入血液抗凝劑;建議重新收集樣本并加入EDTA,肝素,檸檬酸等抗凝劑;

最后歸納一下:低溫是關(guān)鍵,耗材處理好,全副武裝少說(shuō)話(huà)!

祝大家提的RNA濃度高,純度好,實(shí)驗(yàn)順順利利。


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